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乌鲁木齐经济技术开发区(头屯河区)第一人民医院
经济技术开发区（头屯河区）第一人民医院(原乌鲁木齐市头屯河区中心医院）是一所集预防、保健、医疗、教学、康复为一体的综合性二级甲等医院，编制床位数230张。隶属乌鲁木齐经济技术开发区（头屯河区）人民政府管理。
乌鲁木齐儿童医院
乌鲁木齐儿童医院（前身为乌鲁木齐市第一人民医院），成立于1934年2月，1988年经自治区卫生厅批准改建为儿童医院，1997年正式命名为乌鲁木齐儿童医院。
新疆医科大学中医学院直属医院
新疆医科大学中医学院直属医院位于乌鲁木齐市鲤鱼山南路46号，始建于1992年，隶属于新疆医科大学管理的自收自支事业单位法人，经乌鲁木齐市卫生局批准设立的二级中医医院，编制床位99张。乌鲁木齐新市区银川路社区卫生服务中心设在该院，该院系国家中医特色社区卫生服务示范中心，是自治区和乌鲁木齐市城镇居民医疗保险定点医疗机构。
新疆医科大学第五附属医院
新疆医科大学第五临床医学院暨第五附属医院是一所集医疗、教学、科研、预防、康复为一体的综合性三级甲等医院，位于乌鲁木齐市高新区（新市区）中心地带，占地面积约5万平方米，建筑面积约12万平方米，始建于1937年，是自治区首家命名的三级甲等综合医院。医院拥有20个自治区临床重点专科和1个全国综合医院中医药工作示范单位。2014年被健康报评选为“全国最具公信力三级甲等医院”。
新疆医科大学第六附属医院
崛起的新疆医科大学第六附属医院（新疆骨科医院），即原新疆建工医院始建于1957年，地处乌鲁木齐天山区五星路与红山路交汇处。历经几代人艰苦创业，开拓奋进，医院不断发展壮大，已成为集医疗、教学、科研、预防保健、社会（区）服务于一体、具有鲜明骨科特色的综合性二级甲等医院,现为新疆医科大学第六临床医学院。
新疆生产建设兵团医院
新疆生产建设兵团医院正式成立于1982年，坐落于乌鲁木齐市青年路232号，目前已发展成为集医疗、教学、科研、预防、保健、康复为一体的省级综合性三级甲等医院。承担着兵团、自治区、乌市广大人民群众的医疗保健，担负着兵团及全疆疑难危重疾病的诊治和突发公共卫生事件的救治，是商业保险定点医院，自治区、兵团、乌市医保定点医院，同时也是自治区新农合医疗保险定点医院。实现了全疆异地联网结算。
新疆维吾尔自治区人民医院
新疆维吾尔自治区人民医院始建于1934年，是一所集医疗、教学、科研、预防、保健和社区卫生服务为一体的大型综合性“三级甲等医院”。曾先后荣获“全国文明单位”、“全国百佳医院”、“全国五·一劳动奖状”、“全国卫生系统先进集体”、“全国万名医师支援农村卫生工程先进集体”、“全国十大百姓放心医院”、“全国卫生系统思想政治工作先进集体”、“自治区民族团结进步模范单位”等荣誉称号，是中国医院竞争力·顶级医院100强。
新疆医科大学第二附属医院
创建于1954年，经历了50多年风雨历程的新疆医科大学第二附属医院是一所集医疗、教学、科研、康复、预防为一体的省级综合医院，国家卫生部首批认定的“三级甲等”医院，自治区政府评定的“患者满意单位”和自治区级文明单位。
乌鲁木齐米东区人民医院
米东区人民医院建院于1952年，医院占地面积17600平米，建筑面积46000平方米。目前是米东区规模最大，集医疗、预防、康复、保健为一体的二级甲等综合性医院，同时承担着米东区社区卫生服务中心公共卫生服务的一级服务体系。